Med den teknologi, som videnskabsmændene har til rådighed i dag, er der mange måder at støtte teorien om evolution med bevismateriale. DNA-ligheder mellem arter, viden om udviklingsbiologi, og andre bevis for mikroudvikling er rigelige, men forskere har ikke altid haft evnen til at undersøge disse typer bevis. Så hvordan understøttede de evolutionsteorien inden disse opdagelser?
Den vigtigste måde forskere har støttet Evolutionsteori gennem historien er ved at bruge anatomiske ligheder mellem organismer. Viser, hvordan kropsdele af en art ligner kropsdelene af en anden art, samt akkumulerer tilpasninger indtil strukturer bliver mere ens på ikke-beslægtede arter er nogle måder evolution er bakket op af anatomiske beviser. Selvfølgelig findes der altid spor af længe-uddøde organismer, der også kan give et godt billede af, hvordan en art ændrede sig over tid.
Spor af liv fra fortiden kaldes fossiler. Hvordan giver fossiler bevis til støtte for teorien om evolution? Knogler, tænder, skaller, aftryk eller endda helt konserverede organismer kan male et billede af, hvad livet var i tidsperioder fra længe siden. Det giver os ikke kun spor til organismer, der er længe uddøde, men det kan også vise mellemliggende former for arter, når de gennemgik speciation.
Forskere kan bruge information fra fossilerne til at placere mellemformerne på det rigtige sted. De kan bruge relativ datering og radiometrisk eller absolut datering for at finde fossilens alder. Dette kan hjælpe med at udfylde huller i viden om, hvordan en art ændrede sig fra en periode til en anden gennem heleGeologisk tidsskala.
Mens nogle modstandere af evolutionen siger, at fossilrekorden faktisk er bevis på, at der ikke er nogen evolution, fordi der er "manglende links" i fossilprotokollen, betyder det ikke, at evolutionen er usand. Fossiler er meget svære at skabe, og omstændighederne skal være helt rigtige for at en død eller forfaldende organisme kan blive fossil. Der er sandsynligvis også mange uopdagede fossiler, der kunne udfylde nogle af hullerne.
Hvis målet er at finde ud af, hvor tæt to arter er relateret til livets fylogenetiske træ, skal homologe strukturer undersøges. Som nævnt ovenfor er hajer og delfiner ikke tæt forbundet. Dog er delfiner og mennesker. Et bevis, der understøtter tanken om, at delfiner og mennesker kommer fra en fælles stamfar, er deres lemmer.
Delfiner har forreste flippers, der hjælper med at reducere friktion i vand, når de svømmer. Ved at se på knoglerne inden i flipperen er det imidlertid let at se, hvor strukturel den er som den menneskelige arm. Dette er en af måderne, som videnskabsmænd bruger til at klassificere organismer i fylogenetiske grupper, der forgrener sig fra en fælles forfader.
Selvom en delfin og en haj ser meget ens ud i kropsform, størrelse, farve og finplacering, er de ikke tæt knyttet til livets filogenetiske træ. Delfiner er faktisk meget tættere beslægtet med mennesker end de er hajer. Så hvorfor ser de så meget ud, hvis de ikke er beslægtede?
Svaret ligger i evolutionen. Arter tilpasser sig deres miljøer for at udfylde en ledig niche. Da hajer og delfiner lever i vandet i lignende klimaer og områder, har de en lignende niche som skal udfyldes af noget i dette område. Urelaterede arter, der lever i lignende miljøer og har den samme type ansvar i deres økosystemer, har en tendens til at akkumulere tilpasninger, der tilføjer, så de ligner hinanden.
Disse typer af analoge strukturer beviser ikke, at arter er relaterede, men snarere støtter de Evolutionsteori ved at vise, hvordan arter bygger op tilpasninger for at passe ind i deres miljøer. Det er en drivende kraft bag speciation eller en ændring i arter over tid. Dette er pr. Definition biologisk evolution.
Nogle dele i eller på en organismes krop har ikke længere nogen åbenbar anvendelse. Dette er rester fra en tidligere form for arten, inden der blev forekommet speciation. Arten akkumulerede tilsyneladende adskillige tilpasninger, der gjorde, at den ekstra del ikke længere var nyttig. Over tid stoppede delen med at fungere, men forsvandt ikke helt.
De ikke længere nyttige dele kaldes vestigiale strukturer, og mennesker har flere af dem inklusive en haleben, der har ikke en hale forbundet til den, og et organ kaldet et appendiks, der ikke har nogen tilsyneladende funktion og kan være fjernet. På et tidspunkt under udviklingen var disse kropsdele ikke længere nødvendige for at overleve, og de forsvandt eller stoppede med at fungere. Vestigiale strukturer er som fossiler i en organismes krop, der giver ledetråde til fortidens former af arten.