Dette forekommer oftest på grund af geografisk isolering eller reproduktiv isolering af individer i befolkningen. Efterhånden som arten udvikler sig og forgrener sig, kan de ikke længere opdrætte med medlemmer af den originale art.
Fire typer af naturlig speciation kan forekomme baseret på reproduktiv eller geografisk isolering, blandt andet af årsager og miljømæssige faktorer.
Præfikset allo- betyder "andet." Suffikset -patric, betyder "sted." Så allopatric er en type speciation forårsaget af geografisk isolering. De enkeltpersoner, der er isoleret, er bogstaveligt talt på et "andet sted."
Den mest almindelige mekanisme til geografisk isolering er en faktisk fysisk barriere, der kommer mellem befolkningsmedlemmer. Dette kan være noget så lille som et faldet træ for små organismer eller så stort som at blive opdelt af havene.
Allopatrisk specifikation betyder ikke nødvendigvis, at de to forskellige populationer ikke kan interagere eller endda opdrætte med det første. Hvis barrieren, der forårsager den geografiske isolering, kan overvindes, kan nogle medlemmer af de forskellige befolkninger rejse frem og tilbage. Men et flertal af befolkningen forbliver isoleret fra hinanden, og som et resultat vil de afvige i forskellige arter.
Præfikset peri betyder "nær." Når det tilføjes til suffikset -patric, det oversættes til "nær sted." Peripatric speciation er faktisk en speciel type allopatric speciation. Der er stadig en slags geografisk isolering, men der er også en slags instans, der får meget få individer til at overleve i den isolerede befolkning sammenlignet med allopatrisk specifikation.
I peripatriske specifikationer kan det være et ekstremt tilfælde af geografisk isolering, hvor kun et par individer er isoleret, eller det kunne følge ikke kun en geografisk isolering, men også en slags katastrofe, der dræber alle undtagen et par af de isolerede befolkning. Med en sådan lille genpool overføres sjældne gener oftere, hvilket forårsager genetisk drift. De isolerede individer bliver hurtigt uforenelige med deres tidligere arter og bliver en ny art.
Suffikset -patric betyder stadig "sted", og når præfikset para-, eller "ved siden af", er knyttet, betyder det, at befolkningen denne gang ikke er isoleret af en fysisk barriere og i stedet er "ved siden af" hinanden.
Selvom der ikke er noget, der forhindrer individerne i hele befolkningen i at blande og parre, sker det stadig ikke i parapatrisk specifikation. Af en eller anden grund parrer personer i befolkningen sig kun sammen med individer i deres nærområde.
Nogle faktorer, der kan have indflydelse på parapatrisk specifikation, inkluderer forurening eller manglende evne til at sprede frø til planter. For at det skal klassificeres som parapatrisk specifikation, skal populationen imidlertid være kontinuerlig uden fysiske barrierer. Hvis der er fysiske barrierer til stede, skal det klassificeres som enten peripatrisk eller allopatrisk isolering.
Den endelige type kaldes sympatrisk specifikation. Præfikset sym-, der betyder "det samme" med suffikset -patric, hvilket betyder "sted" giver en anelse om betydningen af denne type speciation: Personer i befolkningen er overhovedet ikke adskilt og alle bor på det "samme sted." Så hvordan spredes befolkningen, hvis de lever i det samme plads?
Den mest almindelige årsag til sympatrisk specifikation er reproduktiv isolering. Fortplantningsisolering kan skyldes, at individer kommer i deres parringstider på forskellige tidspunkter eller foretrækker, hvor man kan finde en makker. I mange arter kan valg af kammerater være baseret på deres opdragelse. Mange arter vender tilbage til det sted, hvor de blev født for at parre sig. Derfor ville de kun være i stand til at parre sig med andre, der er født på samme sted, uanset hvor de bevæger sig og lever som voksne.
Andre årsager kan være, at forskellige populationer bliver afhængige af forskellige behov i miljøet, såsom madkilder eller husly.