Metabolisme er det sæt biokemiske reaktioner, der er involveret i opbevaring af brændstof molekyler og omdannelse af brændstofmolekyler til energi. Metabolisme kan også henvise til sekvensen af biokemisk reaktionsforbindelser gennemgår inde i en levende celle. Ordet "stofskifte" kommer fra det græske ord metabolē, hvilket betyder "ændring."
Metabolisme eller metaboliske reaktioner inkluderer anabolske reaktioner og katabolske reaktioner. Anabolske reaktioner syntetiserer eller bygger forbindelser, såsom proteiner, nukleinsyrer, kulhydrater og lipider. Katabolske reaktioner nedbryder komplekse molekyler til enklere, og frigiver ofte energi i processen. Et godt eksempel på en katabolisk reaktion er opdeling af glukose til pyruvat ved cellulær respiration.
Undersøgelsen af metabolisme stammer mindst fra tidspunktet for de gamle grækere. Aristoteles The Animals of Animals beskrev processen med at omdanne mad til anvendelige materialer, frigivelse af varme, når mad blev brugt, og udskillelsen af urin og fæces. I 1260 e.Kr. beskrev Ibn al-Nafis den konstante opbygning og opløsning inden i kroppen i hans arbejde Al-Risalah al-Kaniliyyah fil Siera al-Nabawiyyah (Behandlingen af Kamil om profetens Biografi). Santorio Santorio udførte kontrollerede eksperimenter på stofskifte i 1614, som han skitserede i sin bog
Ars de statica medicina. De kemiske mekanismer til metabolisme blev ikke rigtig forstået før i det 19. århundrede, mens molekylernes strukturer ikke var kendt før i det 20. århundrede.