De fem baser er adenin, guanin, cytosin, thymin og uracil, som har henholdsvis symbolerne A, G, C, T og U. Navnet på basen bruges generelt som navnet på nukleotidet, skønt dette er teknisk ukorrekt. Baserne kombineres med sukkeret for at gøre nucleotiderne adenosin, guanosin, cytidin, thymidin og uridin.
Nukleotider benævnes på grundlag af antallet af fosfatrester, de indeholder. For eksempel vil et nukleotid, der har en adeninbase og tre phosphatrester, blive benævnt adenosintriphosphat (ATP). Hvis nukleotidet har to fosfater, ville det være adenosindiphosphat (ADP). Hvis der er et enkelt fosfat, er nukleotidet adenosinmonophosphat (AMP).
Selvom de fleste kun lærer de fem hovedtyper af nukleotider, er der andre, herunder f.eks. cykliske nukleotider (f.eks. 3'-5'-cyklisk GMP og cyklisk AMP.) Baserne kan også methyleres til dannelse af forskellige molekyler.
Begge DNA og RNA Brug fire baser, men de bruger ikke alle de samme. DNA bruger adenin, thymin, guanin og cytosin, mens RNA bruger adenin, guanin og cytosin, men har uracil i stedet for thymin. Helixen af molekylerne dannes, når to komplementære baser danner hydrogenbindinger med hinanden. Adenin binder med thymin (A-T) i DNA og med uracil i RNA (A-U). Guanin og cytosin komplementerer hinanden (G-C).
At danne en nukleotid, en base, der forbinder til det første eller primære carbon af ribose eller deoxyribose. Antallet af kulstof i sukkeret forbindes til ilt i fosfatgruppen. I DNA- eller RNA-molekyler danner et phosphat fra et nukleotid en phosphodiesterbinding med nummer 3-carbon i det næste nukleotidsukker.
Den kemiske formel for adenin er C5H5N5. Adenin (A) binder til thymin (T) eller uracil (U). Det er en vigtig base, fordi den ikke kun bruges i DNA og RNA, men også til energibæreren molekyle ATP, cofactor flavin adenin dinucleotid og cofactor nicotinamid adenin dinucleotide (NAD).
Selvom folk har en tendens til at henvise til nukleotiderne ved navnene på deres baser, er adenin og adenosin ikke de samme ting. Adenin er navnet på purinbasen. Adenosin er det større nukleotidmolekyle, der består af adenin, ribose eller deoxyribose og en eller flere phosphatgrupper.
Den kemiske formel for puringuaninen er C5H5N5O. Guanin (G) binder kun til cytosin (C), både i DNA og RNA.
Cytosin kan spontant ændres til uracil. Hvis mutationen ikke repareres, kan dette efterlade en uracilrest i DNA.
Uracil er en svag syre der har den kemiske formel C4H4N2O2. Uracil (U) findes i RNA, hvor det binder med adenin (A). Uracil er den demethylerede form af basethyminet. Molekylet genanvendes gennem et sæt phosphoribosyltransferasereaktioner.