Evolutionære ure er genetiske sekvenser inden for gener, der kan hjælpe med at bestemme, hvornår arter divergerede fra en fælles stamfar. Der er visse mønstre af nukleotidsekvenser, der er almindelige blandt beslægtede arter, der ser ud til at ændre sig med et regelmæssigt tidsinterval. At vide, hvornår disse sekvenser ændrede sig i forhold til Geologisk tidsskala kan hjælpe med at bestemme alderen på artenes oprindelse og hvornår der opstod speciering.
Evolutionære ure blev opdaget i 1962 af Linus Pauling og Emile Zuckerkandl. Under undersøgelse af aminosyresekvensen i hæmoglobin af forskellige arter. De bemærkede, at der syntes at være en ændring i hæmoglobinsekvensen med regelmæssige tidsintervaller i hele fossilprotokollen. Dette førte til påstanden om, at den evolutionære ændring af proteiner var konstant i hele den geologiske tid.
Ved hjælp af denne viden kan forskere forudsige, hvornår to arter divergerede på livets fylogenetiske træ. Antallet af forskelle i nukleotidsekvensen for hæmoglobinproteinet betyder en vis tid, der er gået, siden de to arter splittede sig fra den fælles stamfar. Identificering af disse forskelle og beregning af tiden kan hjælpe med at placere organismer på det rigtige sted på det fylogenetiske træ med hensyn til tæt beslægtede arter og den fælles stamfar.
Der er også grænser for, hvor meget information et evolutionært ur kan give om enhver art. Det meste af tiden kan det ikke give en nøjagtig alder eller tid, da det blev splittet af det fylogenetiske træ. Det kan kun tilnærme tiden i forhold til andre arter på det samme træ. Ofte indstilles det evolutionære ur i henhold til konkrete beviser fra fossilrekorden. Radiometrisk datering af fossiler kan derefter sammenlignes med det evolutionære ur for at få et godt skøn over divergensens alder.
Selvom disse faktorer er begrænsende i de fleste tilfælde, er der måder at redegøre for dem statistisk ved beregning af tider. Hvis disse faktorer kommer til at spille, er det evolutionære ur imidlertid ikke konstant som i andre tilfælde, men det kan varieres i dets tider.
Undersøgelse af det evolutionære ur kan give forskere en bedre idé om hvornår og hvorfor der opstod speciation for nogle dele af livets fylogenetiske træ. Disse uoverensstemmelser kan muligvis give ledetråde til, hvornår større begivenheder i historien skete, såsom masseudryddelser.