Aminosyrer er en type organisk syre, der indeholder både en carboxylgruppe (COOH) og en aminogruppe (NH)2). Den generelle formel for en aminosyre er angivet nedenfor. Selvom den neutralt ladede struktur almindeligvis er skrevet, er den unøjagtig, fordi den sure COOH og basisk NH2 grupper reagerer med hinanden for at danne et internt salt kaldet en zwitterion. Zwitterion har ingen nettopladning; der er en negativ (COO-) og en positiv (NH3+) opladning.
Der er 20 aminosyrer afledt fra proteiner. Mens der er flere metoder til at kategorisere dem, er en af de mest almindelige at gruppere dem efter arten af deres sidekæder.
Der er otte aminosyrer med ikke-polære sidekæder. Glycin, alanin og prolin har små, ikke-polære sidekæder og er alle svagt hydrofobe. Phenylalanin, valin, leucin, isoleucin og methionin har større sidekæder og er stærkere hydrofobe.
Der er også otte aminosyrer med polære, uladede sidekæder. Serin og threonin har hydroxylgrupper. Asparagin og glutamin har amidgrupper. Histidin og tryptophan har heterocykliske aromatiske aminsidekæder. Cystein har en sulfhydrylgruppe. Tyrosin har en phenolisk sidekæde. Sulfhydrylgruppen af cystein, phenolisk hydroxylgruppe af tyrosin og imidazolgruppe af histidin viser alle en vis grad af pH-afhængig ionisering.
Der er fire aminosyrer med ladede sidekæder. Asparaginsyre og glutaminsyre har carboxylgrupper på deres sidekæder. Hver syre ioniseres fuldstændigt ved pH 7,4. Arginin og lysin har sidekæder med aminogrupper. Deres sidekæder er fuldt protoneret ved pH 7,4.